Protocolo para detecção do sítio ψβ (Hinc II) no cluster β globina (Haplótipo)
Protocolo de Amplificação
Sequências de Primers:
H5 5´ GAA CAG AAG TTG AGA TAG AGA 3´
H6 5´ ACT CAG TGG TCT TGT GGG CT 3´
- Análise da amplificação em gel de agarose 1,5 %, 80 Volts, 20 minutos
- Tamanho do fragmento = 701 pb
Protocolo de Digestão
FastDigest Hinc II – Fermentas®
Tampão FastDigest Hinc II (10 X) 1,0 µL
FastDigest Hinc II (1 FDU/ ul) 0,5 µL
H2O 8,5 µL
Produto de PCR 5,0 µL
- Colocar em banho-maria a 37° C por 5 minutos
- A análise da digestão deverá ser realizada em gel de agarose 1,5%, 80 volts 30 minutos.
A presença do polimorfismo na região 3’ψβ, reconhecido pela enzima Hinc II (gty↓rac), após a digestão, gera 2 alelos com fragmentos de 360 e 340 pb e a ausência do polimorfismo gera 1 fragmento de 701 pb.